El Aeropuerto Internacional de Sarajevo se encuentra a solo 12 kilómetros del centro de Sarajevo y sirve como conexión con muchas ciudades europeas y el resto del mundo a través de grandes compañías aéreas internacionales como Múnich, Estambul, Viena, Zúrich y otras.
Croatia Airlines conecta Sarajevo con Zagreb, desde donde se pueden realizar conexiones a Bruselas, Frankfurt, Londres, París, Zúrich, Múnich y varias otras ciudades europeas.
Air Serbia conecta Sarajevo diariamente a través de Belgrado, desde donde se puede conectar con otros vuelos internacionales de Air Serbia y sus socios, incluyendo Frankfurt, Ámsterdam y Roma.
El Aeropuerto Internacional de Tuzla es, desde 2020, el segundo aeropuerto más grande del país y cada año recibe un mayor volumen de tráfico de pasajeros. El Aeropuerto Internacional de Tuzla ha abierto numerosas conexiones con destinos internacionales, principalmente hacia Europa Central y Escandinavia.
El Aeropuerto de Mostar se abrió al tráfico aéreo civil en 1965, exclusivamente para vuelos nacionales. Con vuelos chárter estacionales, el Aeropuerto de Mostar está conectado con numerosos destinos internacionales como Düsseldorf, Stuttgart, Milán.
El Aeropuerto Internacional de Banja Luka, también conocido como Aeropuerto Mahovljani, se encuentra a 18 km al norte-noreste de la estación de tren en la ciudad de Banja Luka, la ciudad más grande de la República Srpska y la segunda más grande en Bosnia y Herzegovina.
Las siguientes compañías aéreas realizan vuelos regulares hacia y desde Banja Luka:
Air Serbia – Belgrado
Aviolet – Chárter estacional: Atenas
Freebird Airlines – Chárter estacional: Antalya
Lauda – Viena
Ryanair – Bérgamo, Berlín – Schönefeld, Charleroi, Hahn, Memmingen